自元至清，永定卫、县先后兴办了天门书院、聚奎书院、嵩梁书院、城东书院和瀛洲书院，其中影响较大的是天门书院和嵩梁书院。

天门书院于元代大德七年（公元1303年）建。此前有一位从四川来的“义不臣元”的官吏王申，征得长老和尚的同意，在天门山开馆办学，讲授孔孟之道。澧水河畔有一“先世蜀人，徙居天门山下”的财主田希吕，闻王申在山上开馆办学，以老乡身份，说服父亲和几个叔叔上山“受教，乐闻其说，思结屋以馆公。会大德七年癸卯改慈为州学”，“乃请于官，建学宫，立礼殿讲堂，具祭器，置学田二百亩。提学官闻于朝，名之曰天门书院”。田希吕既出钱办书院，也就被当道聘为山长。此书院开始建在天门“山中，傍邻獠峒，职教罕至”，因年久失修而“摧腐”，后由田怀德“输财力”，“度地于澧水之阳，天门之麓”而另修（见余阙《天门书院记》）。永定卫“士民怀道，鼓箧而至”。有贯侯阿思南海牙为之“欣欣融融，有如邹鲁（引自余阙《天门书院记》）”，教育事业空前兴旺，人材辈出。建院十八年时，山麓杨中进士，擢升待制翰林。建院四十七年时，县人张兑又中进士，授翰林国史编修，受到皇帝接见。当时，一个县出了两个翰林，世人刮目。元至正十二年（公元1352年），书院毁于战火。这个书院，共存了四十九年。现在天门山国家森林公园里的天门书院在以前的书院原址重建。